💧 Vízgyűjtés

→ Környezeti vízminták gyűjtése steril technikával.

🧪 Szűrés

→ A vízminták szűrése membránszűrőkön, hogy a mikrobális sejtek és DNS megmaradjanak.

🧬 DNS-extrakció

→ A szűrt vízmintákból DNS-t izolálunk, hogy a mikrobális közösségek genetikai anyagát kinyerjük.

🔬 DNS-mennyiség meghatározása (Qubit)

→ A DNS mennyiségének meghatározása fluoreszcens módszerrel, hogy biztosítsuk a megfelelő mennyiségű és minőségű DNS-t a további lépésekhez.

📈 Amplifikáció

→ A DNS amplifikálása PCR-rel, például 12S rRNS gén szekvenciák célzott amplifikációjával, hogy a genetikai sokféleséget vizsgálhassuk.

🧫 Gélelektroforézis

→ A PCR-termékek ellenőrzése agaróz gélelektroforézissel, hogy megerősítsük a sikeres amplifikációt és a megfelelő termék méretét.

📦 Szekvenálás

→ A PCR-termékek szekvenálása, hogy a mikrobális közösségek genetikai információját megszerezzük.

💻 Bioinformatika

→ A szekvenált adatok feldolgozása bioinformatikai eszközökkel, például QIIME2 vagy DADA2, hogy azonosítsuk a taxonómiát és közösségi struktúrát.